Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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