Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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