Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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