Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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