Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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