Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RYR3Q15413 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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