Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PDCD1Q15116 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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