Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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