Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms