Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BFSP2Q13515 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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