Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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MKRN4PQ13434 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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