Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLN3Q13286 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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