Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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