Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPS1Q13098 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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