Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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