Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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