Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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