Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNTN1Q12860 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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