Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms