Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF5Q12774 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF5Q12774 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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