Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms