Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms