Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN1BQ07699 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN1BQ07699 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN1BQ07699 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN1BQ07699 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN1BQ07699 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN1BQ07699 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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