Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms