Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ID3Q02535 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms