Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms