Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDM2Q00987 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms