Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2BQ00403 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms