Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMF1P82094 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMF1P82094 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMF1P82094 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms