Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASIC1P78348 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASIC1P78348 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms