Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms