Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RHBDL3P58872 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms