Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME5P56597 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME5P56597 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms