Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB9AP51151 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB9AP51151 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms