Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms