Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA11P31270 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms