Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALDH4A1P30038 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms