Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA1P29973 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms