Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNTFRP26992 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNTFRP26992 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNTFRP26992 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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