Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMO2P25791 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMO2P25791 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMO2P25791 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMO2P25791 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms