Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A1P22736 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms