Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TNNI3P19429 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNNI3P19429 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms