Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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