Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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