Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms