Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP3P12645 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP3P12645 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP3P12645 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms