Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTHFD1P11586 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms