Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRFP10586 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRFP10586 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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