Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXTL3O43909 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL3O43909 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms