Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCO2O43819 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SCO2O43819 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms